MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-020

Total Repeats: 2909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017113	CATCCA	2	12	67	78	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384043653
2	NC_017113	CGGG	2	8	87	94	0 %	0 %	75 %	25 %	384043653
3	NC_017113	GC	3	6	96	101	0 %	0 %	50 %	50 %	384043653
4	NC_017113	ATG	2	6	159	164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384043653
5	NC_017113	TGC	2	6	230	235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043653
6	NC_017113	CCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384043653
7	NC_017113	GCA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043654
8	NC_017113	GCG	2	6	422	427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043654
9	NC_017113	TCA	2	6	444	449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384043654
10	NC_017113	AGG	2	6	526	531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384043654
11	NC_017113	TCTG	2	8	561	568	0 %	50 %	25 %	25 %	384043654
12	NC_017113	CTG	2	6	764	769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043655
13	NC_017113	GCT	2	6	841	846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043655
14	NC_017113	CGTC	2	8	874	881	0 %	25 %	25 %	50 %	384043655
15	NC_017113	TGTCC	2	10	886	895	0 %	40 %	20 %	40 %	384043655
16	NC_017113	GAA	2	6	972	977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384043655
17	NC_017113	AACA	2	8	1292	1299	75 %	0 %	0 %	25 %	384043656
18	NC_017113	CAA	2	6	1336	1341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384043656
19	NC_017113	CAG	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043656
20	NC_017113	GGC	2	6	1474	1479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043656
21	NC_017113	AAC	2	6	1601	1606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384043656
22	NC_017113	CCA	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384043657
23	NC_017113	AGG	2	6	1805	1810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384043657
24	NC_017113	TCA	2	6	1838	1843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384043657
25	NC_017113	T	6	6	1847	1852	0 %	100 %	0 %	0 %	384043657
26	NC_017113	TTG	2	6	1957	1962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384043657
27	NC_017113	A	7	7	2015	2021	100 %	0 %	0 %	0 %	384043657
28	NC_017113	CTG	2	6	2343	2348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043658
29	NC_017113	ACG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043658
30	NC_017113	T	6	6	2388	2393	0 %	100 %	0 %	0 %	384043658
31	NC_017113	GC	3	6	2411	2416	0 %	0 %	50 %	50 %	384043658
32	NC_017113	CGT	2	6	2498	2503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043658
33	NC_017113	TGGC	2	8	2514	2521	0 %	25 %	50 %	25 %	384043658
34	NC_017113	CTA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384043658
35	NC_017113	GCC	2	6	2719	2724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384043659
36	NC_017113	T	7	7	2776	2782	0 %	100 %	0 %	0 %	384043659
37	NC_017113	CGC	2	6	2790	2795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384043659
38	NC_017113	TGT	2	6	2854	2859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384043659
39	NC_017113	AGC	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043659
40	NC_017113	CCA	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384043659
41	NC_017113	GCT	2	6	2998	3003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043659
42	NC_017113	CCG	2	6	3009	3014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384043659
43	NC_017113	GGC	2	6	3025	3030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043659
44	NC_017113	CCT	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384043659
45	NC_017113	CTT	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384043659
46	NC_017113	AAC	2	6	3313	3318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384043660
47	NC_017113	TCGT	2	8	3343	3350	0 %	50 %	25 %	25 %	384043660
48	NC_017113	CGG	2	6	3352	3357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043660
49	NC_017113	TCG	2	6	3373	3378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043660
50	NC_017113	TGT	2	6	3406	3411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384043660
51	NC_017113	ATA	3	9	3528	3536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384043660
52	NC_017113	GAA	2	6	3548	3553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384043660
53	NC_017113	CCAT	2	8	3600	3607	25 %	25 %	0 %	50 %	384043660
54	NC_017113	ATAA	2	8	3657	3664	75 %	25 %	0 %	0 %	384043660
55	NC_017113	TCT	2	6	3709	3714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384043660
56	NC_017113	TTC	2	6	3920	3925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384043661
57	NC_017113	TGT	2	6	3938	3943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384043661
58	NC_017113	ATA	3	9	3968	3976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384043661
59	NC_017113	CCAAT	2	10	4003	4012	40 %	20 %	0 %	40 %	384043661
60	NC_017113	TCC	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384043661
61	NC_017113	TCA	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384043661
62	NC_017113	AGATCA	2	12	4106	4117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384043661
63	NC_017113	A	6	6	4119	4124	100 %	0 %	0 %	0 %	384043661
64	NC_017113	GCA	2	6	4197	4202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043661
65	NC_017113	TGG	2	6	4304	4309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384043662
66	NC_017113	GCGGA	2	10	4420	4429	20 %	0 %	60 %	20 %	384043662
67	NC_017113	TCG	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043662
68	NC_017113	TGGG	2	8	4569	4576	0 %	25 %	75 %	0 %	384043662
69	NC_017113	CCTT	2	8	4594	4601	0 %	50 %	0 %	50 %	384043662
70	NC_017113	TGC	2	6	4827	4832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043663
71	NC_017113	CATG	2	8	4908	4915	25 %	25 %	25 %	25 %	384043663
72	NC_017113	GC	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	384043663
73	NC_017113	CGG	2	6	4959	4964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043663
74	NC_017113	CCA	2	6	5113	5118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384043663
75	NC_017113	CCA	2	6	5125	5130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384043663
76	NC_017113	CCA	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384043663
77	NC_017113	CGG	3	9	5148	5156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043663
78	NC_017113	GGA	2	6	5180	5185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384043663
79	NC_017113	CAC	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384043663
80	NC_017113	GGC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043663
81	NC_017113	TCC	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384043663
82	NC_017113	CCA	2	6	5327	5332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384043663
83	NC_017113	TCG	2	6	5391	5396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043663
84	NC_017113	GTG	2	6	5478	5483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384043663
85	NC_017113	CCA	2	6	5526	5531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384043663
86	NC_017113	GCC	2	6	5567	5572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384043663
87	NC_017113	CAG	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043663
88	NC_017113	CAC	2	6	5636	5641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384043663
89	NC_017113	GTC	2	6	5741	5746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043663
90	NC_017113	TCA	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384043663
91	NC_017113	ATC	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384043663
92	NC_017113	TGAGA	2	10	5929	5938	40 %	20 %	40 %	0 %	384043663
93	NC_017113	AGA	2	6	5962	5967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384043663
94	NC_017113	GCT	2	6	6000	6005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043663
95	NC_017113	CCG	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384043663
96	NC_017113	CTG	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043663
97	NC_017113	GCCTTG	2	12	6177	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043663
98	NC_017113	GCA	2	6	6219	6224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043663
99	NC_017113	GAC	2	6	6241	6246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043663
100	NC_017113	GAC	2	6	6873	6878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043664
101	NC_017113	CTT	2	6	6957	6962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384043664
102	NC_017113	GT	3	6	6966	6971	0 %	50 %	50 %	0 %	384043664
103	NC_017113	CAG	2	6	7105	7110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043664
104	NC_017113	CGGC	2	8	7116	7123	0 %	0 %	50 %	50 %	384043664
105	NC_017113	GC	3	6	7200	7205	0 %	0 %	50 %	50 %	384043664
106	NC_017113	TCG	2	6	7277	7282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043664
107	NC_017113	GAT	2	6	7287	7292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384043664
108	NC_017113	TCG	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043664
109	NC_017113	GGC	2	6	7333	7338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043664
110	NC_017113	GCCT	2	8	7360	7367	0 %	25 %	25 %	50 %	384043664
111	NC_017113	AGC	2	6	7381	7386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043664
112	NC_017113	TCC	2	6	7418	7423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384043664
113	NC_017113	GGGC	2	8	7433	7440	0 %	0 %	75 %	25 %	384043664
114	NC_017113	GCG	2	6	7595	7600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043664
115	NC_017113	GCCA	2	8	7656	7663	25 %	0 %	25 %	50 %	384043664
116	NC_017113	GAT	2	6	7696	7701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384043664
117	NC_017113	ATG	2	6	7739	7744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384043664
118	NC_017113	GCG	2	6	7785	7790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043664
119	NC_017113	ATG	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384043665
120	NC_017113	GC	3	6	8169	8174	0 %	0 %	50 %	50 %	384043665
121	NC_017113	GATG	2	8	8287	8294	25 %	25 %	50 %	0 %	384043665
122	NC_017113	GGC	2	6	8326	8331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043665
123	NC_017113	GATGCC	2	12	8361	8372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384043665
124	NC_017113	CGT	2	6	8381	8386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043665
125	NC_017113	TGA	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384043665
126	NC_017113	GAA	2	6	8456	8461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384043665
127	NC_017113	GGC	2	6	8485	8490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043665
128	NC_017113	GT	3	6	8533	8538	0 %	50 %	50 %	0 %	384043665
129	NC_017113	GTG	2	6	8652	8657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384043665
130	NC_017113	GAT	3	9	8684	8692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384043665
131	NC_017113	GCA	2	6	8733	8738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043665
132	NC_017113	ACGC	2	8	8768	8775	25 %	0 %	25 %	50 %	384043665
133	NC_017113	GCA	2	6	8877	8882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043665
134	NC_017113	CGT	2	6	8904	8909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043665
135	NC_017113	GGCAC	2	10	8920	8929	20 %	0 %	40 %	40 %	384043665
136	NC_017113	GAA	2	6	8985	8990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384043665
137	NC_017113	CCG	2	6	9035	9040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384043665
138	NC_017113	GGA	2	6	9133	9138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384043665
139	NC_017113	GAA	2	6	9141	9146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384043665
140	NC_017113	TC	3	6	9223	9228	0 %	50 %	0 %	50 %	384043665
141	NC_017113	A	7	7	9291	9297	100 %	0 %	0 %	0 %	384043665
142	NC_017113	TCG	2	6	9354	9359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043665
143	NC_017113	GTGC	2	8	9582	9589	0 %	25 %	50 %	25 %	384043666
144	NC_017113	C	6	6	9634	9639	0 %	0 %	0 %	100 %	384043666
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147	NC_017113	CAT	2	6	9881	9886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384043666
148	NC_017113	ATC	2	6	9897	9902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384043666
149	NC_017113	TGATA	2	10	9944	9953	40 %	40 %	20 %	0 %	384043666
150	NC_017113	CACC	2	8	10017	10024	25 %	0 %	0 %	75 %	384043666
151	NC_017113	GA	3	6	10031	10036	50 %	0 %	50 %	0 %	384043666
152	NC_017113	TTG	2	6	10051	10056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384043666
153	NC_017113	CCAT	2	8	10099	10106	25 %	25 %	0 %	50 %	384043666
154	NC_017113	TTG	4	12	10144	10155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384043666
155	NC_017113	TGG	2	6	10229	10234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384043666
156	NC_017113	TG	3	6	10408	10413	0 %	50 %	50 %	0 %	384043666
157	NC_017113	TTC	2	6	10683	10688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384043667
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159	NC_017113	GACG	2	8	10779	10786	25 %	0 %	50 %	25 %	384043667
160	NC_017113	CAG	2	6	10891	10896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043667
161	NC_017113	GTG	2	6	11072	11077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384043667
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163	NC_017113	GCG	2	6	11137	11142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043667
164	NC_017113	AGG	2	6	11172	11177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384043667
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166	NC_017113	GGC	2	6	11206	11211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043667
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168	NC_017113	CGG	2	6	11399	11404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043667
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174	NC_017113	GCCA	2	8	11722	11729	25 %	0 %	25 %	50 %	384043667
175	NC_017113	TGC	2	6	11731	11736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043667
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263	NC_017113	AAT	2	6	16552	16557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384043671
264	NC_017113	CTG	2	6	16600	16605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043671
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266	NC_017113	CA	3	6	16694	16699	50 %	0 %	0 %	50 %	384043671
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391	NC_017113	GATG	2	8	23793	23800	25 %	25 %	50 %	0 %	384043678
392	NC_017113	GTGGC	2	10	23919	23928	0 %	20 %	60 %	20 %	384043678
393	NC_017113	GTCA	2	8	23968	23975	25 %	25 %	25 %	25 %	384043678
394	NC_017113	GCA	2	6	24039	24044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384043678
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396	NC_017113	TTTG	2	8	24102	24109	0 %	75 %	25 %	0 %	384043678
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398	NC_017113	CATC	2	8	24507	24514	25 %	25 %	0 %	50 %	384043679
399	NC_017113	CTG	2	6	24525	24530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384043679
400	NC_017113	ACC	2	6	24545	24550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384043679
401	NC_017113	C	6	6	24603	24608	0 %	0 %	0 %	100 %	384043679
402	NC_017113	TCC	2	6	24681	24686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384043679
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404	NC_017113	CAA	2	6	24821	24826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384043679
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406	NC_017113	GAT	2	6	24839	24844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384043679
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427	NC_017113	AGA	2	6	25958	25963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384043680
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430	NC_017113	TGA	2	6	26042	26047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384043680
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434	NC_017113	CG	3	6	26301	26306	0 %	0 %	50 %	50 %	384043681
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479	NC_017113	CGGA	2	8	29386	29393	25 %	0 %	50 %	25 %	384043681
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493	NC_017113	CCG	2	6	30149	30154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384043683
494	NC_017113	GGC	2	6	30165	30170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043683
495	NC_017113	CCT	2	6	30190	30195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384043683
496	NC_017113	CTT	2	6	30253	30258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384043683
497	NC_017113	AGGAT	2	10	30340	30349	40 %	20 %	40 %	0 %	384043684
498	NC_017113	A	6	6	30378	30383	100 %	0 %	0 %	0 %	384043684
499	NC_017113	G	7	7	30418	30424	0 %	0 %	100 %	0 %	384043684
500	NC_017113	TAA	2	6	30530	30535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384043684

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